報告題目👨‍❤️‍💋‍👨🔖：SIRIUS及其擴展：從串聯質譜數據解析代謝物結構信息

報告人：   Sebastian Böcker

報告時間🧑🏿‍🦱🦻：2024年9月25日（星期三）15:30

報告地點👨🏽‍💼：線下 綠色環境樓200階梯教室

邀請人：   張琨

報告摘要🧄：

    液相色譜質譜（LC-MS）是一種用於分析代謝物和其他小分子物質的高靈敏度實驗平臺🐮。然而🔀🧑🏼‍🦲，從串聯質譜數據中解析代謝物結構依然非常具有挑戰性🩼。在非靶向代謝組學實驗中👨🏿‍⚕️，只有少數譜圖可以通過質譜庫進行註釋。過去十多年裏，Sebastian Böcker教授的團隊一直致力於為這一任務開發計算解決方案🚵🏽。在本次報告中🍞，他將解釋CSI如何在分子結構數據庫中搜索查詢的MS/MS質譜數據；CANOPUS如何為查詢的質譜數據分配數千種化合物類別，即使該化合物在所有結構和質譜數據庫中都不存在；以及COSMIC如何為數據庫搜索結果分配置信度🧖🏼‍♂️。此外，他將介紹SIRIUS 6軟件的新功能，例如整合MSNovelist用於de novo結構解析☝️，以及Epimetheus用於組合碎片分析和結果驗證等內容⚀。

報告人簡介：

    Sebastian Böcker 是德國耶拿弗裏德裏希席勒大學計算機科學研究所的生物信息學教授。他在比勒費爾德大學學習數學7️⃣，並獲得了生物數學博士學位，專註於理論系統發育學👩🏼‍🍼。隨後🙇，他進入工業界工作了三年🎰，開發了用於解釋 DNA/RNA 質譜數據的計算方法。他以獨立研究負責人的身份回到比勒費爾德大學📛，之後在耶拿擔任現任職務。他的研究興趣主要是方法驅動的，最初專註於組合學和算法學；後來，隨機學和機器學習也成為其感興趣的方法。在應用方面🤟🏽，他的研究重點是從質譜數據中註釋小分子，他所在團隊提出的 SIRIUS🌸、CSI:FingerID 和 CANOPUS 被《Nature Methods》評為“值得關註的方法”。此外，他還是德國研究聯合會的埃米·諾特（Emmy Noether）研究員（計算機科學行動計劃），也是亞歷山大·馮·洪堡學會的研究員🌏。2022年，他和團隊獲得了圖林根研究獎👩🏿‍🎤👮‍♂️。